Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF1BP20333 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms