Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDP15428 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HPGDP15428 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms