Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLBP1P12271 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RLBP1P12271 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms