Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TPRP12270 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TPRP12270 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TPRP12270 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms