Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT3P12035 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT3P12035 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT3P12035 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KRT3P12035 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KRT3P12035 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KRT3P12035 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms