Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHGAP10645 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHGAP10645 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHGAP10645 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms