Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf89P0DMQ9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms