Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms