Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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