Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOP08100 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHOP08100 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms