Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPBP07199 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CENPBP07199 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPBP07199 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms