Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB3P05106 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms