Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSVO60911 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms