Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAMEF4O60810 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms