Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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