Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E9PBE3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E9PBE3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E9PBE3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms