Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms