Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A8MUA0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A8MUA0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A8MUA0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms