Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms