Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM221AA4D161 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM221AA4D161 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FAM221AA4D161 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM221AA4D161 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM221AA4D161 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM221AA4D161 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM221AA4D161 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms