Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms