Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAB39Q9Y376 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms