Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC4Q9Y296 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms