Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms