Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNFSF18Q9UNG2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms