Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms