Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms