Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms