Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms