Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms