Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms