Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC17Q9NVM6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms