Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms