Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms