Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms