Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms