Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP8Q9BV40 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms