Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms