Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms