Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms