Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms