Protein–RNA interactions for Protein: Q96LJ8

UBXN10, UBX domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN10Q96LJ8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN10Q96LJ8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.5 ms