Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms