Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms