Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF34Q969K3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms