Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms