Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms