Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRSK1Q8TDC3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRSK1Q8TDC3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRSK1Q8TDC3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRSK1Q8TDC3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRSK1Q8TDC3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRSK1Q8TDC3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRSK1Q8TDC3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms