Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BEST4Q8NFU0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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