Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms